| Seznam |
| Téma: | Softwarová aplikace pro FRET analýzu |
|---|---|
| Vedoucí: | Filip Šroubek; Garant: doc. Ing. Radim Šára Dr. Tech. |
| Vypsáno jako: | Diplomová práce |
| Popis: | Fluorescenční resonanční energetický transfer (FRET) je přenos energie z jednoho fluorescentního barviva na druhé v závislosti na vzdálenosti a tvaru obou barviv. Používá se v molekulární biologii k indikaci vzdálenosti bílkovin.
Jde o časově náročné, složité, nekonzistentní měření. Cílem bude vytvořit software (balíček funkcí) pro zpracování obrazových dat, jehož cílem bude zrychlení práce. Tato práce je součástí projektu ve spolupráci s Einstein Medical School, NY, USA. Aplikace v MATLABu nebo modul do ImageJ. Problémy, které bude nutné řešit: automatická detekce nejlépe zaostřeného snímku, poloautomatická segmentace bílkovin ze série, korekce: odečtení pozadí, kompenzace nežádoucích efektu, přeslechy emisních filtrů, atd. 
|
| Pokyny: | Toto téma bylo navrženo Filipem Šroubkem, Ústav teorie informace a automatizace České akademie věd, http://zoi.utia.cz/. Kontaktujte jej přímo nebo přes Radima Šáru, sara@cmp.felk.cvut.cz, který garantuje externí diplomové práce. Oponent bude určen po dohodě s garantem. |
| Vypsáno dne: | 10.11.2010 |