| Abstract: |  Tato práce se zabývá analýzou národních registrů dárců krvetvorných buněk se zaměřením na geografickou strukturu. Registry obsahují anonymizované údaje o HLA fenotypech dárců a další atributy. Práce se zaměřuje na porovnání genetické podobnosti jedince se skupinou jedinců v regionu. Jedním z atributů u každého jedince je poštovní směrovací číslo, podle kterého jsou jedinci klasifikováni do regionů a poté je podle navržené metriky měřena vzájemná genetická vzdálenost. Vzniklé matice jsou pak vizualizovány pomocí navržené webové aplikace GeoRelatives v podobě přehledných geografických map s barevně odlišenými regiony. Navržený způsob předzpracování dat registru umožňuje zobrazovat výsledky na dotazy v reálném čase. Pomocí experimentů nad českým, finským a švédským registrem je dokázána hypotéza stanovená v úvodu a to že jedinci žijící uvnitř regionů jsou si navzájem HLA geneticky bližší než ve srovnání s jedinci z ostatních regionů. U každého ze zkoumaných registrů byla stanovena míra HLA genetické diverzity. Tento ukazatel přináší informaci o interregionální genetické diverzitě národního registru a také o míře důvěryhodnosti výsledků. Specialistům pracujícím s registrem umožňuje tato aplikace zobrazit k libovolnému HLA fenotypu distribuci genetických vzdáleností přes všechny regiony a vytvořit seznam regionů seřazených od nejbližšího. Při hledání vhodného dárce je tedy pak možné se zaměřit přímo na regiony s menší genetickou vzdáleností od potřebného pacienta a ušetřit čas i peníze celoplošným hledáním.
|
|---|